西南医科大学药学教育始于20世纪五十年代，目前开设有药学、中药学、临床药学三个本科专业。2006年获批硕士学位授权点，与澳门科技大学、泰国清迈大学联合培养药学博士。在校本科生1100余人，研究生200余人，是中国西南地区重要的药学人才培养、科学研究与转化应用基地。

　　现有教职工100余人，其中高级职称50余人、研究生导师40余人、有境外留学经历教师20余人，有国际、国内知名药学专家10余人，有博士学位57人。

　　开设有药理学、药物化学、药物分析、药剂学、药事管理学、临床药物治疗学、生药学、生物技术制药、生物药剂学与药代动力学等20余门主干课程。

　　与20余家大型医院、知名制药企业共建有实践教学基地，为制药企业、科研院所、医疗机构培养从事药品开发、生产与质量控制、药品流通与药物使用等的专门人才。毕业生就业率近100%。

　　拥有2个省级高校重点实验室，实验室面积5000 M2，有超高效液相色谱串联质谱、核磁共振仪、气相色谱-质谱仪等教学科研仪器设备。开展肿瘤个性化免疫治疗、药物缓控释及靶向制剂关键技术创新与应用、肿瘤靶向给药系统的构建、天然药物活性物质生物活性研究、临床药物个体化治疗等特色研究方向。目前正在修建13000 M2的药学大楼和转化医药中心。

　　学院重视对外交流与合作，先后与美国、加拿大、澳大利亚、德国、新加坡、马来西亚、泰国等院校建立友好关系。举办“2018年肿瘤与炎症国际论坛”会议。年均承担科研课题30余项，年均科研经费1000万元，年均发表SCI论文60余篇。申请和授权发明专利近30项，先后获华夏医学科技进步奖、四川省科技进步奖等多项荣誉。