南京中医药大学卫生经济管理学院始建于1995年，由原南京中医药大学社会科学部增设医药管理系而来，2000年正式更名为南京中医药大学经贸管理学院，2006年，原含其中的社会科学部“两课”及心理学教学机构脱离另行成立了人文社会科学学院。2016年4月起更为现名。

　　自建院以来，卫生经济管理学院秉承了南中医悠久的校园文化，质朴的校风学风以及深邃的学术思想，顺应中国经济社会与医药行业发展的潮流，开拓中医药院校多学科为支撑协调发展的教育新格局，积极探索养成学生科学精神与人文素养的综合素质基础以及中外合作办学、校企合作办学、政学合作等多种新型高等教育办学模式，为社会培养和输送了一大批优秀专业人才。

　　学院目前共设有公共管理、经济贸易、信息管理、工商管理、电子商务、药事管理与法律、健康管理与医疗保障等7个系，国际贸易等17个教研室，1个实验中心，3个办公室，4个挂靠研究机构。有独立的教学实验室面积400平米，能同时容纳230人进行实验操作。设在学院的省局共建中医药发展与政策研究中心是国家中医药局中医药政策法规的重要智库研究基地。

　　学院拥有一支以中青年教师为骨干力量，高素质、高学历的富有活力的教师队伍。现有教职工80人，其中专职教师64人；教师中教授、副教授共28人（教授6人，副教授22人）；获得博士学位和在读博士数46人；有3人获得江苏省“333工程”培养对象称号，13人次获得江苏省“青蓝工程”培养对象称号，1人被授予霍英东教育基金会青年教师奖，4人获得先声先进教师奖。

　　学院致力于培养现代国际型、应用型、复合型的高素质人才。以中医药学科为支撑，形成行业定位和专业特色；以现代经济、管理和法学理论为基础，构建学生的专业核心能力；以与政府、企业合作为平台，强化学生的实践创新精神、职业化能力；与国内外知名大学合作，在国际范围内进行师资人才资源的优化组合配置，实现人才资源共享，拓展学生的国际化视野。学院倡导“诚信、朴实、自强、奋进”的学风，不断加强内涵建设，改革教育模式和方法，以学科建设为龙头，带动专业建设和课程建设，（专业设置）现设有公共管理1个硕士学位点学,有国际经济与贸易、公共事业管理、电子商务、市场营销、信息管理与信息系统、药事管理、劳动与社会保障、健康服务与管理等8个本科专业和公共管理1个硕士学位点；1个省级重点建设专业类、2个省特色专业、4个省一流本科专业、1个江苏高校中外合作办学示范项目，2个校级重点学科，1个省级人才培养创新实验区、1个省部共建实验室。现拥有在校本科生1646余人，在校硕、博士生70余人。