京中医药大学第二临床医学院/针灸推拿学院由建校之初的针灸学科点发展而来。1955年，在我校第一任校长、全国中医学界首位中科院学部委员、针灸现代教育创始人承淡安先生的带领下，创立了针灸学学科点。在邱茂良等老一辈针灸学家的倾力建设下，于1982年成立针灸系，在此基础上发展成为第二临床医学院/针灸推拿学院。学院是以培养针灸推拿、康复、中医养生、食品卫生与营养等中医药健康服务人才为特色的学院，目前学院本部有教职工94名，其中专任教师73名（正高职称12人，副高职称22人）。专业技术人员中，中级及以下职称人员全部具有硕/博士学位。各学科有博士生导师16人，硕士生导师39人。目前有国家中医药管理局重点学科3个、江苏省重点学科1个，江苏省中医药重点学科1个，教育部针药结合重点实验室、江苏省人民政府和国家中医药管理局健康养生研究中心，江苏省中医药健康养生技术工程实验室、南京市中医药健康养生工程技术研究中心、江苏省教学实验中心等学科平台。目前在校本科生1291人，研究生90人（其中硕士研究生72人，博士研究生18人）。