昆明医科大学基础医学院是集教学、科研及学生管理于一体的教学单位，其前身为1986年成立的昆明医学院基础医学部，2000年更名为昆明医学院基础医学院，2012年学校更名为昆明医科大学，随之更名为昆明医科大学基础医学院。

　　学院现有人体解剖学与组织胚胎学、病理学与病理生理学、病原生物学与免疫学、生物化学与分子生物学、细胞生物学与医学遗传学、生理学、药理学、物理数学与计算机科学等8个系；设有基础医学实验教学中心，下设形态学、机能学、细胞生物学与分子生物学、病原生物学与免疫学、人体解剖学等5个实验室；有昆明医科大学神经科学研究所和昆明医科大学热带医学研究所2个科研机构；设党政综合办公室、教学办公室、学科及科研管理办公室、团委、学生工作办公室等5个管理机构。学院现有教学用房面积3万平方米，正在建设3.7万平方米的医药基础实验大楼，预计2018年年内投入使用。

　　学院现有教职工237人（专任教师179人，实验技术人员47人），正高级职称26人，副高级职称80人；具有博士学位59人，硕士学位130人，有博士生导师11人，硕士生导师66人；云南省高端人才1人、教育部新世纪人才1人、云岭教学名师1人、省级教学名师5人。

　　学院坚持以教学为中心，以人才培养为目标，积极开展教学改革，教学质量不断提高。现承担本科生、研究生、留学生和成人继续教育等多层次教学任务，开设基础必修课60余门，选修课50余门。学院以改革为动力，以提高教学质量为核心，稳步推进以“器官系统”为中心的教学改革，取得显著成效。目前有省级教学团队1个、省级实验教学示范中心3个、省级虚拟仿真实验中心1个，省级精品课程3门、省级双语示范课程3门，省级精品视频公开课2门，校级精品课程5门、校级双语示范课程10门、校级混合式课程建设项目6项。近五年获国家级教改项目1项、省级2项、校级49项，获云南省教学成果一等奖1项、二等奖2项，获国家级讲课比赛二等奖2人次，出版规划教材编写94部，其中主编24部、副主编16部，参编54部。

　　学院以疾病防治为导向，紧密结合我省区位、资源和民族优势，紧跟学科前沿，以常见多发病、热带传染病和区域高发肿瘤等基础医学关键问题为重点，在寄生虫分类与跨境传染病防治、区域高发肿瘤与脑缺血、临床应用解剖学与小胶质细胞活化调控、肿瘤和神经及传染病免疫、法医毒理学和法医无证学等5个研究领域，形成了区域特色鲜明的基础医学学科研究体系。近五年承担科研项目176项（师均1.67项），纵向及横向课题总经费为6383.3万元（师均51.48万元）。其中国家级项目77项，研究经费4487.5万元，省部级科研项目99项，研究经费1649.5万元。目前在研科研项目98项，其中国家自然科学基金37项、省部级科研项目52项，项目总经费3439.25万元（师均27.74万元）。近五年发表第一作者或通讯作者SCI收录论文285篇，其中影响因子