科研系列设1院4所2室21中心:海洋材料科学与工程研究院、船舶与海洋工程研究所、安全科学与工程研究所、航运环境保护研究所、港口航道与海洋工程研究所，上海市高校重点实验室"深海极端环境服役材料实验室"、宝钢股份"海洋极端环境钢铁材料制备与蚀损控制联合实验室"，以及上海市海洋局深海装备材料与防护工程技术研究中心等21个科研中心。

　　学位点系列设:3个二级学科博士点(海洋运输工程材料与防护、海岸与海洋工程管理、交通运输安全与环境工程);1个一级学科硕士点"水利工程"， 1个工程硕士点(水利工程领域);6个二级学科硕士点:海洋运输工程材料与防护，交通运输安全与环境工程，港口、海岸及近海工程，水工结构工程，水文学与水资源，海岸与海洋工程管理。

　　学院现有教职工123人:专任教师96人(教授17人，副教授25人，博士学位94%)，实验教师16人、思政教师7人、行政管理人员4人。有教育部特聘教授1人、国务院特殊津贴专家1人、上海市领军人才1人，教育部新世纪人才1人、上海市优秀技术带头人1人、上海市教学名师1人，曙光学者1人、晨光学者5人、交通青年科技英才2人、青年东方学者2人。学院现有在校生1548人(本科生1302人，各类研究生161人)。

　　学院主要研究领域有:海洋极端环境钢铁材料制备与蚀损控制、海洋材料微生物附着机制及防污技术、高技术船舶设计与制造、海洋结构物设计建造及性能评估、船舶与海洋结构物水动力性能、海洋运输安全与公共安全工程、火灾爆炸和危化品安全、船舶及港口防污染技术、近海海域环境污染控制技术、海岸与深海水动力、港口与海岸工程技术等，其中深海材料研究达国际先进水平。